Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SDSP20132 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SDSP20132 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SDSP20132 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SDSP20132 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SDSP20132 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SDSP20132 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SDSP20132 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms