Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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