Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM35Q9UPQ4 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM35Q9UPQ4 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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