Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms