Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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