Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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