Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CRIP3Q6Q6R5 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms