Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC93Q567U6 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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