Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC96Q2M329 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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