Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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GEN1Q17RS7 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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GEN1Q17RS7 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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