Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ME3Q16798 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ME3Q16798 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ME3Q16798 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms