Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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