Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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