Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPE65Q16518 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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