Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC6Q16204 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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