Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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