Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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