Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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