Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IRF4Q15306 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms