Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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