Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDCD1Q15116 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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