Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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