Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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