Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NCAPHQ15003 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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