Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms