Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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