Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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