Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TUBB3Q13509 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms