Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
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