Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TMED1Q13445 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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