Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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