Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATMQ13315 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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