Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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