Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IFT88Q13099 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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