Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK2Q13002 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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