Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CSTF3Q12996 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CSTF3Q12996 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CSTF3Q12996 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CSTF3Q12996 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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