Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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