Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TWF1Q12792 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms