Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
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