Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
E2F1Q01094 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
E2F1Q01094 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F1Q01094 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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