Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPFP49454 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPFP49454 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
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CENPFP49454 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
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CENPFP49454 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPFP49454 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPFP49454 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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