Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTPRGP23470 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRGP23470 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTPRGP23470 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
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PTPRGP23470 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
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PTPRGP23470 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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PTPRGP23470 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRGP23470 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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