Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms