Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Pdzd9Q9D9M4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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