Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms