Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CygbQ9CX80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CygbQ9CX80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms