Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RpainQ9CWY9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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