Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms