Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms