Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp397Q7TNK4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms